保護柱是液相色譜分析中重要的色譜耗材，使用保護柱可大大降低分析柱受污染的程度，延長分析柱使用壽命。
保護柱的正確使用方法：
1、專柱。避免保護柱成為不同項目的交叉污染源。
2、及時更換保護柱。當峰的理論塔板數下降15%，或是柱壓上升15%，或是關鍵分離度下降15%時，都應該及時更換保護柱。
3、不慎發生強污染時，可以將分析柱卸下，單獨沖洗保護柱，可以使污染物更快的從保護柱中流出。——但是不可以超聲保護柱。
保護柱使用注意事項：
1、獨立式保護柱與分析柱連接時，連接管路盡可能短，且接口切面平滑，盡量減少死體積以降低柱外展寬效應。
2、卡套式保護柱一般未標注液流方向，使用時建議自行標注，并按照標注方向來使用，以免正反向使用后，截留的雜質污染分析柱。
3、直接填裝的短柱型保護柱，出現柱壓升高或峰型變差時，可不接分析柱進行反向清洗，清洗溶劑可參考分析柱清洗溶劑。
4、卡套式保護柱，柱芯替換時，注意柱芯與柱套是否存在方向上的匹配，同時不易旋擰過緊，以防滑絲。
5、保護柱或柱芯一般不建議超聲清洗，因可能對填料表面修飾有影響。
6、如同一保護柱配不同的分析柱使用，每次使用前，保護柱需先清洗并用流動相平衡保護柱一段時間后，再接分析柱使用。
